癫痫外科治疗与癫痫内科治疗的最大不同就是通过外科手术的方法切除癫痫起源区，现有的癫痫外科理念是将与癫痫相关的脑区依据脑电生理和解剖结构的不同分成癫痫起源区和癫痫激惹区、癫痫的激惹区。这些可以依据脑电能够明确，但是癫痫起源区有时是不容易判定的。