癫痫是大脑异常放电引起的，脑电图查的就是每个细胞发出的不同电流。而有电流的地方就会产生磁场。因此脑磁图通过检测磁场，也能定位异常脑电波的起源。由于磁场不受颅骨、头皮等阻碍，最终偏差可能小于1毫米，其结果也更精确。但这一方法价格昂贵、操作复杂，需要医生排除外界干扰，且必须在完全隔离的密闭房间内进行，所以临床使用率要低于脑电图。