甲流是由甲型流感病毒感染造成的发热、呼吸道症状的急性呼吸道传染病。而禽流感是由禽流感病毒，实际上禽流感病毒严格意义上讲，也是一种甲型流感病毒感染所引起来。只是甲型流感病毒感染禽类以后，在禽类的体内复制、传播，然后由禽类再感染人造成，也是有发热、呼吸道症状来表现的呼吸道传染病。所以们之间的区别主要就在于病原体的来源不同。甲流感染以后，主要是引起来急性的发热、全身肌肉酸痛、头痛、呼吸道表现。而禽流感主要是引起急性发热、咳嗽、咳痰的呼吸道症状，也会有全身肌肉疼痛、头痛、乏力，甚至还有恶心呕吐等胃肠道的表现。从临床表现上来说，两者的区别并不是太大。所以临床上，如果要诊断是甲流感染还是禽流感，主要是在于流行病学史，也就是当地有没有甲流的流行，还是有禽流感的流行。另外就要看患者病毒的核酸检测，到底是禽流感病毒还是甲流病毒。
在日常生活中，对于患者的危害性，实际两者差不多，所以患者有发热、呼吸道的症状，持续高热不退，在当地要及时的就诊，以免耽误病情的诊治。