沙眼衣原体阳性，说明出现了沙眼衣原体的感染。沙眼衣原体是导致眼部患有沙眼最常见的原因。沙眼是由于衣原体感染结膜组织后所形成的炎症，通常是由于患者不注意眼部卫生引起的，例如用脏手揉眼睛，用污染的水源洗脸，与沙眼患者共用毛巾、脸盆等个人卫生用品都容易引发沙眼。
一旦出现沙眼，患者会表现出眼睛充血发红，分泌物增多、眼部异物感、刺痛感，睑结膜面形成滤泡及瘢痕组织，角膜缘形成血管翳等表现。治疗上需要通过在眼部点盐酸左眼氟沙星滴眼液，利福平滴眼液，磺胺醋酰钠滴眼液等药物进行治疗，从而清除沙眼衣原体感染。