子宫内膜厚度5mm是比较薄的，基本上不会来月经。育龄期女性的子宫内膜是卵巢的靶器官，子宫内膜分为基底层和功能层。随着卵巢的周期性变化，子宫内膜的功能层也会受到卵巢所分泌的激素的影响，而发生相应的周期性变化。雌激素会使子宫内膜增厚，内膜细胞增多增大，间质内的小动脉会变得迂曲，呈螺旋状，称为增殖期子宫内膜。排卵之后，由于雌激素和孕激素的共同作用下，可以使子宫内膜发生水肿，腺体产生大量的黏液和糖原，子宫内膜厚度会进一步加厚，称为分泌期的子宫内膜。
如果此时排出的卵细胞受精了，则受精卵会经过输卵管，运送到子宫内发育，称为妊娠。妊娠组织会合成一种绒毛膜促性腺激素，可以支持卵巢的黄体继续发育，使子宫内膜会进一步增厚，转变成蜕膜组织以利于胚胎的种植和发育，有一部分蜕膜日后可能会发展成为胎盘。如果卵细胞没有受精，在排卵后的14天左右，卵巢的黄体就会萎缩，停止分泌雌激素和孕激素。此时，子宫内膜中的血管儿会发生收缩，内膜坏死而脱落引起出血，就形成了月经。
所以在月经的不同时期，子宫内膜的厚度是不同的。一般在月经刚结束之后，第一天到第三天左右，子宫内膜的厚度是最薄的，可能在0.3到0.6cm左右，最后，有的人可能会达到0.7cm左右。在两次月经中间的时候，也就是排卵期的时候，大多数的子宫内膜的厚度是在0.7到1.1cm左右。而在经前，子宫内膜会稍微厚一点，子宫内膜的厚度可以达到1.5cm左右。
所以子宫内膜如果只是5mm也就是相当于月经刚干净的水平，一般情况下这时候是不会来月经的。导致子宫内膜过薄的常见原因也有很多种，一方面是内分泌失调，像多囊卵巢综合征、高泌乳素血症，常会出现卵泡不发育、不排卵、雌激素水平低，而使子宫内膜增殖不良。第二个就是子宫内膜损伤，像一些宫腔手术之后，有可能会造成子宫内膜的损伤而出现子宫内膜过薄。