新生儿黄疸绝大多数是，以间接胆红素升高为主的黄疸，这种黄疸都是可以治疗的，可以通过光疗，严重的话，通过换血治疗是可以治疗的，相当一部分直接胆红素，通过药物，相当一部分的直接胆红素升高的这部分黄疸，可以通过药物或者是外科的干预来进行治疗，仅有极少部分，由于染色体或者是基因以及原发病难以治疗而导致的黄疸的消退困难，治疗上困难，临床常见的是以间接胆红素升高为主的。
最大的一个黄疸这类的黄疸治疗，我们可以采取蓝光照射，光的作用下的话，使未结合胆红素异构化，形成构象异构体和结构异构体，然后从尿里面排泄出来，这种的话可以采用蓝光或者绿光，平时的日光灯也有一定的疗效。目前国内常用是蓝光照射，将新生儿仰卧于光照箱中，双眼的话用黑色的眼罩保护，以免损伤视网膜，会阴及肛门部也要进行保护，用单面光或者是双面光进行治疗，可以采取连续的光疗或者是间断光疗，一般的话，在胆红素下降到7毫克每分升以下的话，我们可以考虑停止光疗，光疗过程中要补充维生素B2，严重的话需要换血治疗，其他的还有一些药物可以减少胆红素的产生。
另外增加胆红素跟蛋白质相结合的能力纠正酸中毒，还可以用一些肝酶的诱导剂，其他的还有一些是支持治疗，主要是要防止有缺氧酸中毒，或者是寒冷损伤，一些饥饿、感染，这些因素如果有了严重的黄疸，在进行积极的退黄之后，还要定期的到儿童发育门诊，做健康随访也是说要除外一下，有没有黄疸引起的脑部的一些损害，特别视力和听力都需要进行检测。