甲型流感最常见的并发症是并发病毒性肺炎，在此基础上继发细菌、真菌的感染，还可以出现嗜睡、神志改变等中枢神经系统的损伤，可以出现脑炎、脑膜炎、急性坏死性脑病等神经系统的并发症，还可以出现心肌炎、心包炎、心功能不全、急性加重等心脏的并发症。还可以出现肌痛、肌无力，出现横纹肌溶解等并发症，还可以出现脓毒性休克、急性呼吸综合征以及多器官功能衰竭，以上均为甲型流感的并发症。

感染甲型流感病毒后引起病毒性肺炎的时候，一般外周血白细胞是正常的或者是降低的，对于继发细菌性肺炎的患者则会出现外周血白细胞的升高，伴有中性粒细胞比例的升高。同时还合并外周血炎症指标，比如说c反应蛋白、降钙素原的升高，当外周血出现白细胞升高、中性粒细胞比例升高，以及外周血的炎症指标升高的时候，要高度警惕。甲型流感病毒引起肺炎同时继发了细菌的感染，此时除了给予患者特异的抗病毒药物还要给予相应的抗细菌治疗。

禽流感是由禽流感病毒引起禽类的急性传染性疾病，人可由禽流感病毒引起急性呼吸道传染病，禽流感病毒属于甲型流感病毒，除了感染禽类还可以感染人、猪、马等动物。甲型流感是由甲型流感病毒引起的人的急性呼吸传染病，禽流感和甲型流感引起的临床表现是相似的。但是禽流感少数患者是表现为轻症的，多数患者一般有出现肺炎的表现，可以通过进行上呼吸道标本的核酸检测来确定，禽流感和甲型流感的类型及其亚型。

甲型流感病毒和乙型流感病毒的区别，是甲型流感病毒的抗原变异速度比较快，常常出现新的亚型，常可引起世界范围内的大流行。而乙型流感病毒的抗原变异速度较慢，仅仅引起局部的小流行，所以甲型流感对人类的危害大，重症患者病例数多，但甲型流感病毒和乙型流感病毒感染的病人，他们的临床表现是相似的。另外甲流和乙流的治疗上都应用特异的抗病毒药物，神经氨酸酶抑制剂，这也没有明显的区别。

病人感染甲型流感病毒以后，要经过1~7天的潜伏期。在潜伏期末，往往可以检测到病毒，也就是说一般来说，核酸检测阳性到患者的发热症状逐渐缓解，病毒可能检测。一般来讲，发热缓解以后，认为就检测不出病毒。所以在这个过程中，大概一般是在1~7天左右，就是一周左右，如果患者没有明显的病情的进展，没有进展到重症或者危重症，患者病情迅速缓解，发热缓解，咳嗽、呼吸道的情况改善，一般是在7天左右可以转阴。对于一部分患者，一些具有高危因素的患者，就是常常提到的老年患者，以及合并高血压、糖尿病等等合并症比较多的这部分患者，高热持续不退，病情不能缓解。因此主要原因也是跟病毒持续复制有关系，这部分患者的转阴时间，就要根据病情具体评估而定。