甲型肝炎病毒感染人体后，一般引起急性的肝损伤。急性的肝损伤在临床表现上，主要有明显的消化道症状，病人表现为恶心、呕吐、厌油食，轻的病人可以有食欲不振、乏力、肝区不适、肝脏肿大等。如果病人出现黄疸，可以有皮肤发黄、眼睛巩膜黄染、小便颜色深黄像浓茶一样。
除了这些临床表现以外，病人还会有肝损伤、肝功异常的生化检查结果，转氨酶往往超过500以上，甚至上千，胆红素也会升高。病毒的血清学检查，可以出现甲肝抗体IgM阳性。