乙肝抗病毒治疗疗效首先需要根据乙肝病毒的DNA的定量情况推断体内乙肝病毒扩散程度，若是较少则可证明疗效好。同时，根据乙肝病毒E抗原也可以评价乙肝抗病毒治疗疗效，乙肝病毒E抗原减少，说明体内乙肝病毒扩散速度较慢，治疗效果好。而且根据乙肝病毒表面抗原逐渐减少也能评价乙肝抗病毒治疗疗效好。