十二指肠球溃疡治疗以质子泵抑制剂，是拉唑类药为主，临床上是奥美拉唑、艾司奥美拉唑、兰索拉唑以及雷贝拉唑和泮托拉唑等，都是以抑制胃酸为主，促进十二指肠球溃疡愈合；如没有找出十二指肠球溃疡原因，有部分人存在幽门螺旋杆菌感染，根除幽门螺旋杆菌感染仍然是十二指肠球溃疡治疗主要方法，常用四个药，两种抗生素加质子泵抑制剂加铋剂，常见是阿莫西林和克拉霉素，阿莫西林加甲硝唑，阿莫西林加左氧氟沙星等，目前用四环素加呋喃唑酮、及加质子泵抑制剂加铋剂，能够得到很好根除HP效果。