巧克力囊肿通常大于5厘米的时候需要做手术治疗。巧克力囊肿一般为良性的病变，容易使腹部出现坠胀和疼痛，较大时则需要通过开放性手术切除，防止局部的囊肿持续性的增大，还有利于缓解腹部出现的坠胀和疼痛症状，有利于身体恢复到健康状态。手术需要到三甲医院选择专业医师，相对于安全性较高，有利于降低风险程度。