生殖器疱疹经常复发是由于治疗不彻底，或者是不良的性生活等导致的。交叉感染，通过性生活复染，导致病情反复。不能有效清除病毒，存在于上皮组织内的病毒不能被有效的清除。生活不检点，性关系混乱，导致反复感染。不可靠的治疗方法，或非专科治疗，或疗程不够，导致治疗上的不彻底，产生复发。生殖器疱疹的治疗一定要按照疗程进行治疗，经过多次复查没有复发迹象时才能够停止治疗。