小叶性肺炎的病原微生物一般都是细菌。如果确诊为细菌感染造成的小叶性肺炎，轻症的患者可通过抗生素治疗，如头孢克肟、阿莫西林、莫西沙星、左氧氟沙星、青霉素V钾片、阿奇霉素等。重症的患者可通过抗生素治疗，如头孢米诺、头头孢呋辛、孢地嗪钠、头孢西丁等。同时建议完善痰培养检查，通过药敏试验选择合适的抗生素，同时再给予镇咳、祛痰、退热等相关治疗。上述药物使用要在医生建议下使用。