扁桃体炎可以通过药物或者手术的方法治疗，如果是反复发作的扁桃体炎，经常出现脓肿还可以选进行手术治疗。扁桃体炎不仅因为本身炎症蔓延会使邻近器官的感染，如中耳炎、鼻窦炎，喉、气管、支气管炎等，为人体常见的感染病灶之一，与急性肾炎、风湿性关节炎、风湿热、心脏病、长期低热等疾患关系密切。在扁桃体炎反复发作时抗感染治疗，扁桃体过度肿大或发生肿瘤等疾病时亦应手术治疗。