结核病筛查的副作用主要是要进行CT检查，CT有一定的辐射。但一般来说这个辐射量是相对安全的，如果半年或者一年做CT都是正常人可以接受的。对于孕妇来说还是不建议做CT检查，因为CT的辐射对胎儿会有一定的影响，可能会导致胎儿畸变。如果患者的结核病非常严重，那么就要用抗结核治疗来观察病情的变化。