沙眼衣原体检查阴性，这个意思是说在标本里面没有检测到沙眼衣原体。若是患者确实是有泌尿生殖系统感染炎症的表现，查沙眼衣原体阴性，是说炎症可能不是因沙眼衣原体感染所引起的，可能有其他原因，如支原体以及淋球菌感染引起的。沙眼衣原体是类似于细菌的微生物，但是细胞内寄生的。一般易侵犯人体泌尿生殖系统的粘膜上皮细胞，引起非淋菌性尿道炎，宫颈炎等疾病。若是检测到沙眼衣原体阴性，就基本上可以排除是所引起的炎症。