新冠感染通常是指新型冠状病毒感染。一般情况下，新型冠状病毒感染和扁桃体炎的区别在于部位不同、症状不同和病因不同。
1.部位不同：新冠感染属于上呼吸道感染，发生在肺部，而扁桃体炎属于下呼吸道感染，发生在咽喉部位。
2.症状不同：新冠感染主要表现为发热、咳嗽、咳痰、呼吸困难、胸痛等。而扁桃体炎主要表现为咽喉疼痛、声音嘶哑、吞咽困难。
3.病因不同：新冠感染主要跟新型冠状病毒的感染有关。而扁桃体的发病主要跟金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、非溶血性链球菌、腺病毒等病原微生物的感染有关。