亚急性甲状腺炎的最佳治疗方法应该根据症状轻重来对症治疗。早期治疗以减轻炎症反应及缓解疼痛为目的。轻症可用非甾体抗炎药；急性期首选肾上腺皮质激素类药物，初始大剂量维持1—2周，根据症状、体征及血沉变化缓慢减少剂量，总疗程6—8周以上。过快减量、过早停药可使病情反复，根据红细胞沉降率调整激素用量；甲状腺毒症明显者，可使用β肾上腺素受体阻滞剂。甲状腺激素可用于甲减症状明显、持续时间久者；永久性甲减需长期用甲状腺激素替代治疗。