慢性结膜炎的治疗，主要是要找出病因，才能对症下药。若是因病菌感染又对治疗无效时，则必须检测出致病菌才能给予有效的药剂。如果是外界环境造成，则应尽量避免接触刺激源，如减少外出可以减少风吹及接触油，烟，灰尘。若是眼睑的问题，如倒睫及眼睑外翻，有时须考虑手术治疗。若是慢性眼睑炎，则须花费更多心力治疗，除清除眼睑缘之分泌物外，热敷，洗净睫毛及点药膏和口服抗生素都有帮助。平常要爱护眼睛，可以经常做眼保健操，注意眼部卫生。