结膜炎和角膜炎的发病病因基本相同，主要包括感染因素和非感染因素，前者主要有病毒、细菌、真菌、衣原体、结核杆菌等因素，非感染因素主要包括物理因素、免疫因素，化学灼伤等。根据病因的不同，选择的药物也不同，对于细菌感染者，可使用抗生素类药物，如左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液。对于病毒感染者，使用抗病毒药物，如更昔洛韦眼用凝胶、利巴韦林滴眼液，对于真菌类引起者，使用抗真菌药物，如那他霉素，同时如果患者存在角膜损伤情况，可加用促进角膜修复药物，如贝复舒，必要时可选用糖皮质激素。