1、肾结石常常会伴有尿路梗阻的情况，这一并发症一般就是导致男性的梗阻以上部位积水，如下输尿管结石可造成中、上输尿管及肾盂积水。结石的梗阻通常是不完全性梗阻，若双侧输尿管或尿道梗阻则可出现尿闭，严重者发展为尿毒症。2、肾结石的并发症还有就是导致的局部损伤，一般小结石活动度大，局部损伤较轻。大而固定的结石，可使肾盏、肾盂上皮细胞脱落，出现溃疡、纤维组织增生，以致间质纤维化。移行上皮长期受结石刺激后，可发生鳞状上皮变性，多年后右引起鳞状上皮癌。结石常损伤血管，引起血尿。3、感染也是男性肾结石很常见的一种并发症，常见结石的感染可发生肾盂肾炎、肾积脓、肾周围炎及肾周围脓肿和膀胱炎等。