局部损伤：若小的肾积水活动度大，局部损伤较轻。大而固定的肾积水，可导致肾盏、肾盂上皮细胞出现脱落，出现溃疡还可出现纤维组织增生，以致间质纤维化。移行上皮如果长期受到肾积水刺激后，肾积水的并发症可出现鳞状上皮变性，多年后右引起鳞状上皮癌。肾积水通常会损伤血管，引起血尿。尿路梗阻：肾积水的并发症通常可导致梗阻以上部位积水，如下输尿管积水可造成中、上输尿管及肾盂积水。肾积水的梗阻通常是不完全性梗阻，如果双侧输尿管或尿道梗阻则会出现尿闭，严重的肾积水的患者可发展为尿毒症。感染：肾积水可合并的感染，在肾积水排出或取出前，是很不容易治好的。此种感染会出现肾盂肾炎、肾积脓、肾周围炎及肾周围脓肿和膀胱炎等。