间质性膀胱炎的病因尚不明确，但是有很多学术著作提供不同的影响因素，包括感染、自身免疫、炎症、肥大细胞、膀胱氨基葡聚糖和上皮渗透型、神经支配尿液异常和其它的潜在原因。大量的研究证据表明，间质性膀胱炎涉及神经免疫及内分泌等因素相互作用而引发的综合症。间质性膀胱炎的患者建议首先进行心理治疗，随后配合进行行为治疗以及物理治疗。