(1)免疫力低下：同时有些患者免疫力低下，如合并有
糖尿病、肿瘤、肝病、
营养不良或其他慢性疾病，对
睾丸炎的治疗也造成很多困难。(2)潜伏隐匿感染：部分微生物引起的睾丸炎经抗生素治疗后，因药效和疗法的缺陷细菌将进入潜伏感染状态，在饮酒、劳累、精神紧张等因素可能诱使潜伏致病菌繁殖，从而出现症状，即睾丸炎复发。(3)隐深部位的感染：由于致病菌隐藏于组织深层，以及潜藏于睾丸隐窝，睾丸旁腺等部位，使得药物很难对其全面杀死，给康复留下了后患。(4)并发症的影响：如若病情反复，长期炎性损害，造成尿路黏膜、肾盂肾盏受损、纤维化、变形，尿路梗阻、畸形影响了正常的尿液引流和治疗，都给睾丸炎的治疗带来影响，使得传统的药物治疗疗效不佳，治疗更加困难。
