放射性肠瘘的治疗效果大多数比较好，也有一小部分患者，会出现腹腔感染、吻合口的愈合不良、身体机能下降、多脏器衰竭、营养不良等。但要视个人的体质、肠瘘的位置、大小、原有的疾病等情况而定。轻度的患者，可能会有少量的肠液从瘘管中流出，只要将肠液引出来，并进行消毒即可。严重的患者要先找出瘘口，再通过外科手术，并配合肠外营养进行辅助治疗。