在临床上出现肛门里面疼痛，最常见的原因就是肛周脓肿。继发于细菌感染，又称为坐骨直肠周围间隙脓肿。根据脓肿与肛提肌位置分为高位脓肿和低位脓肿，一般来说，低位脓肿主要是疼痛不适，肛周部皮肤出现红肿热痛，波动感阳性。高位脓肿一般来说，主要出现肛门里疼痛不适，局部皮肤红肿热痛，并不明显。但是因为脓肿位置比较高，容易经过血液，进入全身循环而出现，畏寒高热，等脓毒血症症状。对于肛周脓肿，一般通常需要行血常规检查以及B超甚至CT检查，诊断明确后通常需要及时行脓肿切开治疗。肛门里面出现疼痛除了肛周以外，其他原因还包括肛裂，通常是因为干结粪便在排出时损伤。肛管粘膜。引起肛门括约肌收缩，引起的疼痛。一般在急性期采用保守治疗，慢性期通常需要行手术治疗。