慢性髓系白血病的并发症仍然是感染、贫血、出血和肿瘤细胞浸润，感染见于各种系统感染，如呼吸系统、泌尿系统、消化系统、皮肤系统等，致病菌可为细菌，也可为病毒、结核、支原体、衣原体等。当贫血程度严重时，会使患者感到疲劳、运动耐受性下降、头晕、头痛等，需要输注红细胞支持治疗，出血可以从轻微到严重。儿科可出现皮肤和粘膜瘀点、牙龈出血和鼻出血，严重者可出现眼底出血甚至脑出血，肿瘤细胞侵袭主要表现为淋巴结肿大、肝脾肿大，可引起局部压迫症状。