肠结核和克罗恩病是完全不同的疾病。肠结核是由结核分枝杆菌引起的。克罗恩病是一种特殊的疾病。主要致病因素包括全身免疫力低下、特殊感染甚至遗传因素。肠结核和克罗恩病的鉴别在于肠结核病人的PPD值呈强阳性，克罗恩病基本呈阴性或弱阳性。