患有鹅口疮的患儿也会引起很多并发症，比如吞咽困难、脱水和败血症等，建议及时治疗。治疗婴儿鹅口疮的办法如：
1、一般治疗，用弱碱性溶液，如2%～5%碳酸氢钠（小苏打）清洗。应加强营养，特别适量增加维生素B2和维生素C。婴儿室应注意隔离和哺乳的消毒，以预防传播。
2、药用治疗，涂擦冰硼油（中药冰硼散做成糊状蜜剂）、制霉菌素混悬剂等效果良好。