药物流产可能导致不孕或妊娠困难，因为药物流产出血时间长，出血量大，感染机会大，如子宫内膜炎、子宫肌层、输卵管炎等感染。将导致输卵管阻塞和随后的妊娠困难。药物流产也容易引起月经不调、月经量少、内分泌失调，导致排卵异常，从而影响女性怀孕。