最常见的感染来自龋齿和牙髓病，其次是继发于根尖孔、侧副根管和牙本质小管的牙周病。血源性感染相对罕见。根尖周病感染的主要病原菌是根尖微生物产生混合感染，其中牙龈卟啉单胞菌是主要病原菌。细菌和细菌代谢产物如内毒素通过病理性免疫反应引起根尖周炎。