厌氧菌肺炎抗菌治疗疗程在无并发症的厌氧菌肺炎为2～4周，坏死性肺炎或肺脓肿为6～12周。目前，对于经验性治疗，青霉素仍然是治疗厌氧肺炎的首选药物。头孢霉素和碳青霉烯类抗生素可用于重症患者。体位引流有助于排痰，纤维支气管镜检查有时用于吸引肺脓肿的痰。无效的保守治疗或怀疑肿瘤进行手术指征，10%~20%的肺脓肿患者需要手术治疗。