肝棘球蚴病的临床表现通常不是很明显，并且在开始阶段通常没有任何症状。随着囊肿继续增加，它们会触及上腹部肿块，腹胀和腹痛。如果囊肿位于右上肝，则可能会出现呼吸系统症状。有些患者可能有过敏反应症状。少数患者可能由于胆道上的囊肿压力而出现黄疸症状，或者由于感染或进入胆道而可能发生胆管炎或败血病，侵入胸腔的患者可能有呼吸道症状或支气管胆瘘。