高能自闭症的主要原因与遗传因素、脑部结构以及脑功能异常、生物学机制有关，此外，重金属中毒、空气污染等因素与高能自闭症也可能有关。高能自闭症的常见诱发因素主要就是母孕期不利因素以及后天环境因素，母孕期不利因素主要就是高龄孕妇、先兆流产等等。