治疗线粒体心肌病可以用抗血小板聚集类的药物进行治疗，也可以用中成药来进行治疗，这些药物治疗的效果都是非常良好的。除此之外，为了能够让氧气进入到心肌细胞的线粒体之中，临床常常用持续低流量吸氧的方式来进行治疗，对于治疗线粒体心肌病有着非常大的帮助。