新生儿非感染性腹泻原因比较复杂。分泌腹泻：有很多因素刺激小肠或大肠分泌过多的水，电解质超过吸收能力，偶尔发生的腹泻。吸收不良性腹泻：电解质吸收障碍会导致一系列与吸收减少和分泌增加相关的腹泻病。胃肠蠕动加速腹泻：粘膜通透性异常，肠吸收面减少，吸收受到抑制。新生儿引发腹泻的另一个重要原因是父母经常更换多种品牌的配方奶粉。