子宫囊肿通常是指宫颈腺囊肿。它是慢性宫颈炎的表现，如宫颈糜烂和宫颈息肉。在宫颈糜烂的愈合过程中，新的鳞状上皮覆盖了宫颈腺体的口。或者它延伸到腺管以阻塞腺体的嘴，在腺管周围的结缔组织增生或疤痕形成会压迫腺管，使腺管变窄甚至阻塞，腺体分泌物的引流被阻塞，并且由保留形成的囊肿也称为子宫颈贮藏。