支原体感染本身就具有自限性疾病，如果只是轻度感染，是好治疗的，并不严重。但也有一些会造成心，肾以及神经系统等并发症，重症支原体肺炎还会出现肺不张以及闭塞性细支气管炎，若发生上述并发症，则支原体感染较重。虽然肺外并发症通过对症治疗，也会恢复，但可能会留下较为严重的后遗症。