丙型肝炎直接抗病毒药物与其他药物相互作用，可能增加或减少抗病毒药物在血液中的浓度，使药物的疗效发生不同程度的影响;或影响其他药物的代谢，使药物不良反应发生的风险增加。

慢性乙型肝炎急性发作可以发生在慢性乙肝病毒感染的任何状态下，但主要发生在免疫耐受期慢性乙肝病毒携带者中，也可以发生在肝功能轻度异常的慢性乙型肝炎患者或非活动期HBsAg携带者中。

乙肝病毒对核苷(酸)类药物产生耐药的原因与患者的感染状态、病毒复制水平及其抵抗力、药物的选择及患者治疗的依从性等因素有关。处于免疫耐受期的乙肝病毒感染者绝大多数都是自幼感染，乙肝病毒在人们免疫功能还不能认识它们时“乘虚而入”，与免疫系统“和平共处”。

丙型肝炎的感染年龄与乙型肝炎不同，乙型肝炎多为自幼感染，感染年龄越小，慢性化程度越高;而丙型肝炎多为成年期感染。在全球，丙型肝炎感染者中55～64岁人群的比率最高，在美国3/4的感染者是1945-1965年出生的人群。

机体免疫系统对原病毒抗原产生的抗体，在迅速突变的新病毒株面前很快失效;而再产生刚刚能对抗新病毒抗原时，病毒又发生了新的变化，从而逃避人体免疫系统对它的清除。因此，至今没有研究出预防丙肝病毒感染的疫苗，也没有有效的免疫学方法预防或治疗丙肝病毒感染，而且导致病毒感染后容易难以清除，成为慢性感染者。