正常头皮上有许多微生物，包括葡萄球菌，丙酸杆菌和马拉色菌，与头皮屑原因有关的微生物是马拉色氏菌。头皮屑与角质层中游离脂肪酸，胆固醇和神经酰胺的水平显着降低有关，导致头皮的水屏障被破坏并减少了角质层的水合作用，从而使其体积和面积变小，破裂和形成规模。