肛门闭锁又叫肛门直肠异常，此病是新生儿先天性疾病，大约3000名新生儿中有1个患病的几率。在胚胎阶段，泌尿生殖系统和直肠系统都有共泄腔。从胚胎第五周开始逐渐形成隔膜，到第九周泌尿生殖系统和直肠完全分离。若在上述进化过程中暂停进展，肛门直肠不能降至正常位置，导致直肠盲端或肛门盲端出现泌尿生殖道或肠瘘。