儿童癫痫的病因是非常复杂的，一般是有先天的和后天的。先天性疾病通常与遗传有关，特别是近年来在一些遗传检测中发现的异常遗传变化。后天是很多，在怀孕期间，如果有一些孕妇患有高血压、低血糖、糖尿病等会导致儿童大脑发育异常，这些原因都会导致癫痫发作。一些缺氧，早产，其他出生时，等等也会导致癫痫。出生后对大脑的一些损害，比如常见的一些颅内感染、脑外伤等遗传代谢疾病，都会导致癫痫发作。