一般情况下，头皮毛囊炎是否会自愈取决于毛囊炎的面积大小。
如果只是偶发性的毛囊炎，面积比较小，并且患者的生活和休息时间比较规律，随着自身抵抗力的增强，可能会自愈；但如果毛囊炎面积大，有明显化脓性感染，一般不能自愈，需要积极治疗，应该及时清洁枕套，可适当给予热敷，也可遵医嘱使用莫匹罗星软膏、盐酸多西环素片等药物进行治疗。