脂肪肝与原发性肝癌的发生并无直接关系，但引起脂肪肝的一些原因，如饮酒、营养不良、药物、毒性损害等，不仅是脂肪肝的病因，也是肝癌的病因。因此，脂肪肝对肝癌的发生有辅助作用，可以增加癌变的可能性。另一方面，由于大量肝细胞长期积累脂肪，严重影响了肝细胞的血液供应和代谢，导致肝细胞大量肿胀、炎性损伤和坏死。如果病变时间较长，肝脏组织会继续有纤维组织增生，形成假小叶，最终发展成肝硬化程度。在肝硬化的基础上，癌变的可能性增大。