一般来说，用药物来治疗肺栓塞的副作用是比较小的，但是可能由于一部分人无法把握用量，导致过量使用药物就可能会出现流鼻血，牙龈出血等副作用的出现。但是相对来说，用药物来治疗肺栓塞的效果是要比其他治疗方法好一些的，平时注意用量就好了。