手术是治疗小儿甲状腺癌的主要方法，甲状腺癌全切除可以保证不明显病灶的切除，便于术后放射性碘的诊断扫描，使病灶在远处直接转移。甲状腺全切除术治疗甲状腺癌预后良好，即使有远处转移，生存率也很高，但术后并发症是主要的死亡原因。还有放射性碘治疗，它会影响儿童的生长发育，并有诱发白血病的风险，所以，不应广泛应用于儿童。