连花清瘟胶囊对于流感引起的咳嗽、咽干、头痛等症状有一定的治疗作用，如果咳嗽是流感引起的，可以服用这种药物治疗。但是咳嗽的原因很多，比如咽炎、气管炎、肺炎等，虽然此时咳嗽服用连花清瘟胶囊也有一定的治疗作用，但是最好能服用一些止咳糖浆，止咳化痰的效果会更好一些。