导致小儿有先天性心脏病可能是遗传因素，如果家族中有这个疾病的话，那么自己的孩子出现这个情况的几率就是比较大的，那么第二胎和第三胎出现此病的概率也很大。同时近亲婚配也是导致出现此种疾病的重要原因。一些孕妇平时有抽烟喝酒的习惯，或者是吸入过多的二手烟，会导致胎儿畸形和小儿先天性心脏病的发生。