小儿扁桃体发炎的原因有可能是病毒感染或者感冒引起的，但是比较常见的就是宝宝长期消化不良，受外邪入侵的时候引发扁桃体发炎。平常要注意适量喂食，避免一次性摄入食物过多以免消化不良。扁桃体炎的致病原以溶血性链球菌为主，其他如葡萄球菌、肺炎球菌、流感杆菌以及病毒等也可引起。