潜伏感染是生殖器疱疹复发的根本原因，其机理尚未完全明了。潜伏HSV的复活与其胸苷激酶基因有关，但复活机制尚不明。潜伏HSV复活的触发因素有免疫因素和非免疫因素，后者包括激素内分泌因素与物理因素，这些因素影响宿主神经节细胞与病毒间的相互作用。